فصل دوم: بررسی منابع 2-1-گیاهشناسی 5 2-2-ساختمان بوته: 6 2-3- شرایط مناسب رشد 7 2-4- قدمت و منشا 7 2-5-گونه‌‌‌‌‌های مهم جنسAllium 8 2-6- اهمیت پیاز 8 2-6-1-اهمیت اقتصادی – تجاری 8 2-6-2-اهمیت تغذیه ای – بهداشتی 9 2-7-اهداف به نژادی 9 2-8- اهمیت مطالعه منابع ژنتیکی 9 2-9- نشانگر‌‌‌‌‌های ژنتیکی 11 2-9-1-نشانگر‌‌‌‌‌های مورفولوژیک 11 2-9-2-نشانگر‌‌‌‌‌های مولکولی 11 2-10- توالی های تكرار شونده 15 2-11-مقایسه انواع مختلف نشانگر ‌‌‌‌های DNA 15 2-12- ریز ماهواره ها 17 2-12-1-سطح چند شكلی: 18 2-12-2-تکامل ریز ماهواره ها 18 %d9%86%d8%a7%d9%85%d9%87%d9%85%d8%b7%d8%a7%d9%84%d8%b9%d9%87-%d8%aa%d9%86%d9%88%d8%b9-%da%98%d9%86%d8%aa%d9%8a%da%a9%d9%8a-%d8%af/#_Toc223012717″>2-12-3-مدل های جهش ریزماهواره ها 19 2-12-4-تشخیص ، فراوانی و توزیع ریز ماهواره ها در ژنوم 20 2-12-5-عمل ریز ماهواره ‌ها 21 2-12-6-مزیت‌‌‌‌‌ها و معایب ریز ماهواره‌‌‌‌‌ها 22 2-13-نشانگر ISSR 23 2-13-1-چند شکلی در ISSR: 23 2-13-3-مزایا و معایب نشانگر ISSR 24 2-14-مروری بر پژوهش‌‌‌‌‌های انجام شده روی تنوع ژنتیكی در پیاز 24 فصل سوم: مواد و روشها 3-1-تهیه نمونه‌ها 27 3-2-استخراج DNA ژنومی 29 3-3-تعیین کمیت و کیفیت DNA 30 3-4-آغازگر های SSR 31 3-4-1-بهینه سازی شرایط واکنش PCR برای آغازگر‌های مورد استفاده 33 3-4-2-انجام واکنش PCR با آغازگر های SSR 33 3-4-3-الکتروفورز محصول PCR روی ژل اکریل آمید (PAGE) 35 3-4-4-تفسیر ژل و تجزیه آماری داده ها 37 3-5-آغازگر های ISSR 38 3-5-1-بهینه سازی واکنش PCR برای آغازگر های ISSR 39 3-5-2-انجام واکنش PCR با آغازگر های ISSR 39 3-5-3-الکترفورز محصول PCR روی ژل آگارز 41 3-5-4-تفسیر و تجزیه آماری داده ها 41 فصل چهارم: نتایج و بحث 4-1-استخراج DNA ژنومی 42 4-2-نشانگر SSR 44 4-2-1-بهینه سازی شرایط واکنش PCR برای جفت آغازگر های SSR 44 4-2-2-الکترفورز محصول PCR روی ژل پلی اکریل آمید 44 4-2-3-نتایج حاصل از استفاده از نشانگر های SSR 45 4-2-4-تجزیه به مولفه های اصلی در نشانگر SSR 58 4-3-نشانگر ISSR 60 4-3-1-بهینه سازی شرایط واکنش PCR برای آغازگر های ISSR 60 4-3-2-الکتروفورز محصول تکثیر شده به وسیله ISSR بر روی ژل آگارز 61 4-3-3-نتایج حاصل از نشانگر ISSR 61 4-3-4-تجزیه به مولفه های اصلی در ISSR 73 4-4- بررسی نتایج حاصل از ادغام دو نشانگر SSR و ISSR 75 4-4-1-تجزیه به مولفه های اصلی در ادغام دو نشانگر SSR و ISSR 77 فصل پنجم: نتیجه گیری كلی و پیشنهادها 5-1-نتیجه گیری كلی 79 5-2- پیشنهاد ها 81  

فصل اول

مقدمه

1-1-اهمیت و اهداف کار